miércoles, 29 de abril de 2015

Clostridium perfringens

Clostridium perfringens

Nom


  • Nom científic: Clostridium perfringens.

Classificació


  • Fílum: Firmicutes
  • Classe: Clostridia
  • Ordre: Clostridiales
  • Família: Clostridiaceae
  • Gènere: Clostridium

Característiques morfològiques:


  • Gram positius.
  • Cèl·lules amb forma de bacil.
  • De 1 a 4 micròmetres.
  • S’agrupen en colònies grans.
  • No motilitat.
  • Algunes són encapsulades.

Característiques metabòliques:


  • Bacteris anaerobis estrictes.
  • Fermentació butírica
    • Font C: glucosa, lactosa i sacarosa (carbohidrats).
    • Acceptador d’electrons: inorgànics (nitrats).
    • Producte final: CO2 i H2.
  • Incapacitat per reduir sulfats.
  • Necessitats complexes pel seu creixement, necessiten medis amb aminoàcids i diversos factors de creixement.

Característiques ecològiques:

  • Formador d’endòspores in vitro per tolerar condicions extremes. Viuen al sòl i en sediments d’àrees amb pol·lució fecal.
  • Les espores són resistents a 100ºC 1 hora i la germinació es produeix a 70-80ºC.
  • Es troba distribuït àmpliament pel medi ambient però es troben freqüentment a l’intestí dels humans i d’alguns animals.
  • Hi ha cinc tipus de Clostridium perfringens: A, B, C, D i E. Destacant A i C com a capaços de produir una malaltia infecciosa en humans.

Altres característiques, aplicacions o problemàtiques:

  • És patogen tant pels animals com per l’home.
  • Utilitzat com a indicador de contaminació fecal.
  • Producció de toxines que poden causar malalties com la gangrena gaseosa.
  • La temperatura òptima de les toxines és de 43-47ºC i necessita un pH pròxim a 7’5.

Bibliografia:





Autors i autores: Genís Gisbert, Laura González, Laia Illa i Esther Lucha.

Chlamydia spp.

Chlamydia spp.

Nom

  • Nom científic: Chlamydia spp.
  • Nom comú: Clamídia

Classificació

  • Filum: Chlamydiae
  • Classe: Chlamydiae
  • Ordre: Chlamydiales (Storz i Page,1971)
  • Família: Chlamydiaceae (Rake, 1957)
  • Gènere: Chlamydia (Jones et al., 1945)

Característiques morfològiques:

  • Morfologia: Coc-Bacil
  • Gram: Gram negatiu, tot i que la seva membrana no hi ha presència de peptidoglicà.
  • Mida: 0’2 – 1’5μm de diàmetre
  • Motilitat: No en té.

Característiques metabòliques:

  • Tipus de metabolisme
    • Font d’energia: La font d’ATP és la cèl·lula hoste ja que no se’l pot sintetitzar per si mateix.
    • Font de poder reductor (e-): precursos metabòlics.
    • Font de carboni: carbohidrats
    • Acceptor extern d’electrons: oxigen
    • Reciclatge del NADH: present, a la cadena de transport.

Característiques ecològiques

  • Són paràstis intracel·lulars obligats de cèl·lules eucariotes animals.
  • Temperatura corporal de l’hoste
  • El seu cicle està dividit en dues fases. L’EB o elementary body que és la forma de dispersió i que té el metabolisme inactiu; i l’RB o reticular body que és l’encarregat de duur a terme la reproducció.
  • L’EB té la capacitat de crear una inclusió al entrar a la cèl·lula evitant així la degredació dels lisozims.

Altres característiques, aplicacions o problemàtiques

  • Infeccions generalment localitzades en teixits mucosos. Com la cèrvix, l’úter i l’anus.
  • En biotecnologia s’utilitza la proteïna de la membrana externa de la Chlamydia trachomatis per la diagnosis d’anticossos i la creació de vacunes.
  • El gènere chlamydia pot generar diverses malalties depenent de quina sigui l’espècie infecciosa.
    • Chlamydia psittaci pot produir ornitosis i psicatocis en humans de forna ocacisonal..
    • Chlamydia trachomatis produeix diferents patologias tals com, infeccions oculars, infeccions genitals i artritis reactiva.
    • Chlamydia pneumoniae pot produir faringitis, otitis i pneumònia atípica.


Bibliografia:



Treponema spp.

NOM

  • Nom científicTreponema spp.
  • Nom comú: Treponema

CLASSIFICACIÓ TAXONÒMICA
  • Fílum: Spirochaetes
  • Classe: Spirochaetes
  • Ordre: Spirochaetales
  • Família: Spirochaetaceae
  • Gènere: Treponema


CARACTERÍSTIQUES MORFOLÒGIQUES

Treponema spp. són microorganismes Gram-negatius els quals tenen forma d'espiral. Aquesta morfologia és típica de les espiroquetes (Figura 1).


                        Figura 1:  Imatge de Treponema pallidum. S'observa la forma característica de les espiroquetes.

Presenten una forma helicoïdal o sinusoïdal, el cos és fi i prim, allargat i molt flexible. La seva mida oscil·la entre 0'1 i 0'4 µm de diàmetre i 6 i 10 µm de llargada. Les espires que presenten es troben molt juntes i distribuïdes regularment. Els extrems del cos són afilats.

Estan cobertes per àcid hialurònic, fosfolípids, estructures fibril·lars i peptidoglicà. La seva paret cel·lular és una envolta externa de glicosaminoglicans.

Els microorganismes del gènere Treponema tenen mobilitat en medis líquids gràcies a la presencia d’endoflagels periplasmàtics que, com el seu nom indica, es troben en l’espai periplasmàtic (entre les membranes interna i externa) per on poden circular. Es tracta de dos flagels que s’originen a cada extrem del microorganismes i apunten cap al interior del cos. Aconsegueixen la motilitat amb sistemes de rotació o translació dels endoflagels.

Aquests microorganismes no presenten pigmentació. Per aquest motiu, i per la seva mida reduïda, Treponema spp és molt difícil d’observar pel que es requereix un microscopi de camp fosc o la realització d’una tinció especialitzada (normalment tinció argèntica).



CARACTERÍSTIQUES METABÒLIQUES

Treponema spp. obté l'energia i el carboni de la matèria orgànica (hidrats de carboni i/o aminoàcids) (quimiohetro-). És un microorganisme que realitza una respiració anaeròbica estricte  o microaeròfila (requereix l'absència d'oxigen o la presencia d'aquest en unes concentracions molt baixes). El poder reductor o la font d'electrons també és un compost orgànic (organo-). Per tant, Treponema spp. és un microorganisme quimioorganoheteròtrof.

Les espècies del gènere Treponema que són paràsites depenen del seu hoste per adquirir els àcids grassos i la majoria dels aminoàcids, ja que ells no els poden sintetitzar. Treponema pallidum té una dependència absoluta del seu hoste.


CARACTERÍSTIQUES ECOLÒGIQUES

Hi ha tres tipus d’espècies de treponemes sapròfites que tenen vida lliure. Altres es troben en la flora humana com la que podem trobar a la placa dental, la cavitat bucal, els intestins i els genitals amb una relació de comensalisme. També hi ha espècies paràsites que es troben a la pell i les secrecions genitals de diferents hostes com els humans o els gossos.

Les espiroquetes moren ràpidament amb la dessecació o amb l’augment de temperatura. També són sensibles als compostos amb l'arsènic, el mercuri i el bismut.


ALTRES CARACTERÍSTIQUES, APLICACIONS O PROBLEMÀTIQUES

Hi han espècies del gènere Treponema que són patògenes. A la Taula 1 es mostren diferents característiques que presenten aquestes espècies:

Taula 1: Característiques d'espècies del gènere Treponema. Es mostra la patogènia i el diagnòstic.

Hi ha diverses espècies de treponemes patògenes per a l’home:


  • Treponema pallidum: ocasiona sífilis. Aquesta malaltia és la tercera malaltia bacteriana de transmissió sexual (ETS) a nivell mundial. El tractament es realitza amb penicil·lina. Si es dona un cas d'al·lèrgia, el tractament es realitza amb doxiciclina o macròlids.


  • Treponema pertenue; Bacteri causant de la malaltia de pian.


  • Treponema carateum: Aquest microorganisme causa la malaltia de pinta.

La prevenció dels afectes de les malalties causades per aquests microorganismes es basa en un diagnòstic i tractament precoç, exàmens serològics durant l’embaràs, utilització de preservatiu (sífilis) i en l'educació sanitària de la població.


Anna Gràcia, Noelia López, Esther Martínez i Sònia Vivo

    

Acidithiobacillus ferrooxidans

NOM

  • Nom científic: Acidithiobacillus ferrooxidans (també se l'anomena Thiobacillus ferrooxidans).

CLASSIFICACIÓ TAXONÒMICA

  • Fílum: Proteobacteria
  • Classe: Gammaproteobacteria
  • Ordre: Acidithiobacillales
  • Família: Acidithiobacillaceae
  • Gènere: Acidithiobacillus


CARACTERÍSTIQUES MORFOLÒGIQUES

Els Acidithiobacillus ferrooxidans són bacteris gramnegatius, amb aspecte de bacil. Aquests microorganismes solen tenir una mida mitjana d'entre 0'5 i 0'6 µm d’amplada i 1 i 2 µm de llargada. Tenen un flagel polar encarregat de la seva mobilitat. (Figura 1).


Figura 1:  Imatge de Acidithiobacillus ferrooxidans. S'observa el flagel en posició polar.

Aquests tipus de microorganismes es solen trobar agrupats en parelles i molt rarament formant cadenes curtes 

CARACTERÍSTIQUES METABÒLIQUES

Acidithiobacillus ferrooxidans utilitza els ions de ferro i sofre com a principal font d'energia (quimio-). Les fonts de poder reductor i donador d'electrons són l'hidrogen (H2) el sofre ( S0), el ferro (Fe2+) i compostos de sofre (lito-). La font de carboni inorgànica, el  CO2 (auto-) Acidithiobacillus ferrooxidans és un bacteri respirador aeròbic, és a dir, realitza la fosforilació a nivell de substrat i la respiració oxidativa. L'acceptor extern d'electrons a la cadena de transport electrònic és l'oxigen. Així doncs, aquest microorganisme és respirador aeròbic amb un metabolisme quimiolitoautotròfic.

CARACTERÍSTIQUES ECOLÒGIQUES

Es sol trobar en coves o drenatges àcids de mines, com en els residus de carboni. Aquets bacteris són microorganismes acidòfils (prosperen en medis àcids) amb un pH d’entre 2'5 i 3'5, on converteixen metalls insolubles al seu estat soluble.

ALTRES CARACTERÍSTIQUES, APLICACIONS I PROBLEMÀTIQUES

Algunes aplicacions de Acidithiobacillus ferrooxidans en la indústria són:

  • Biolixviació

Procés pel qual un conjunt de bacteris tenen la capacitat d’alliberar el metall de valor present en un mineral, els quals disolen un mineral i els solubilitzen.
Acidithiobacillus ferrooxidans, és un dels principals bacteris, el qual ha estat molt estudiat. Va ser aïllat per primera vegada en unes aigües d’una mina de carbó, al 1947, identificant-la com la primer bacteri capaç de facilitar el procés de purificació del coure.

  • Biorremediació

En la bioremediació s’utilitzen mitjans biològics per a la descontaminació de diferents ambients, en aquest cas Acidithiobacillus ferrooxidans, que presenta una alta capacitat per absorbir metalls pesats.
Acidithiobacillus ferrooxidans és combinat amb altres bacteris, augmentant l’eficiència del procés, ja que aquests microorganismes presenten una característica anomenada bioacumulació.


Anna Gràcia, Noelia López, Esther Martínez i Sònia Vivo

Shigella; Shewanella; Pseudomonas putida

·       Nom: Shigella spp.

·    Classificació:
Filum:Proteobacteria
Classe: Gammaproteobacteria
Ordre: Enterobacteriales
Família: Enterobacteriaceae
Gènere: Shigella

·       Característiques morfològiques:
Morfologia: bacils curts
Agrupació: sense agrupació
Gram: Gramnegatiu
Mida: mesuren de 0.7 µm a 3 µm
Motilitat: sense motilitat
Pigmentació: colònies blanques en agar MacConkey

·       Característiques metabòliques: Quimioorganotròfic i fermentatiu.
Font d’energia: fermentació de l’àcid mixta (sense producció de gas; no té l'enzim formiat-liasa). No pot fermentar la lactosa o ho fan molt lentament.
Font de poder reductor (e-): poden reduir nitrats
Font de carboni: glucosa (acetat)
Acceptor extern d'electrons: carboni
Reciclatge de NADH: Es reoxida el NADH+H
Requeriments nutricionals específics o particularitats fisiològiques: Catalasa positius, oxidasa negatius. Roig metil positiu. Tres de les quatre espècies de Shigella són resistents a varis antibiòtics.

·       Característiques ecològiques:
Condicions òptimes de creixement: 37ºC
Tipus d’adaptacions: Presenta càpsula
Habitat: intestí gros, recte i a l’intestí prim (final de l’ili) dels humans i alguns primats. Rarament s’endinsa més enllà de la làmina pròpia
Llocs on es poden trobar: aigua, aliments contaminats i femtes d’animals infectats
Abundància:
Dispersió: no presenten espores
Ubiqüitat: Poden viure en el menjar i en l’aigua. Infecten animals de sang calenta. Entre un 5% i un 15% dels casos de diarrees de la població mundial són deguts a Shigella

·       Altres característiques, aplicacions o problemàtiques:
Especificitats genètiques o evolutives: Trobem quatre espècies: S. disenteriae, S. boydii, S. flexneri, S. sonnei. La majoria d’elles són resistents a varis antibiòtics.
Patologies que pot generar: sense símptomes/ Femtes aquoses/ Disenteria o Shigellosis: diarrea sanguinolenta, febre, pèrdua de la gana, nàusees i vòmits. Els símptomes comencen de 1 a 3 dies després de la ingesta de Shigella. Provoca úlceres i inflamacions al tracte digestiu.
Problemes de contaminació: La mínima presència d’aquest bacteri en algun aliment o en l’aigua ja és significant ja que concentracions baixes del microorganisme ja poden causar la infecció.
Intoxicació: ingesta d’aigua o aliments contaminats, i contactes oral-fecal.


bergey’s manual of systematic bacteriology vol.1
http://shigell.blogspot.com.es/ 



        Nom: Shewanella spp.

· Classificació:
  Filum: Proteobacteria
Classe: Gammaproteobacteria
Ordre: Alteromonadales
Família: Shewanellaceae
Gènere: Shewanella

·       Característiques morfològiques:
Morfologia: Bacilar
Gram: Gramnegatiu
Mida: mesuren de 2 µm a 3 µm
Esporulació: no esporulats
Flagelació: Polar
Pigmentació: colonies taronjes en agar-sang

·       Característiques metabòliques:
    És respirador aerobi facultatiu.
   Poden utilitzar com a acceptor d’electrons l’oxigen, Mn(IV), Fe(III), U(VI), Cr(VI) i el nitrat, entre d’altres. Utilitzen materia orgànica com a font de carboni i d'electrons.
   És resistent a la penicilina i sensible a Carbapenemes, AG, Cefalosporines de 3ª i 4ª, Quinolones,Eritromicina, TMS.

        Característiques ecològiques:
   Són sapròfits i rarament són patògens per l’espècie humana.
   Normalment es troben en ambients marins, però també els podem trobar a tot tipus de reserves aquàtiques, a reserves energètiques naturals, a produccions alimentàries d’origen animal i a ambients terrestres.

Altres característiques, aplicacions o problemàtiques:
Shewanella spp. té varies aplicacions:

      A l’àrea de medi ambient: reciclatge de metalls per reducció dels metalls a partir de compostos orgànics halogenats, òxid de Ferro III, Mn(IV), per respiració anaeròbica ( S’han realitzat molts estudis amb un espècie en concret d’aquest bacteri, Shewanella oneidensis, ja que, tal com he dit abans, té la capacitat de precipitar metalls tòxics de manera que deixin de ser solubles en el medi. Varis investigadors estan estudiant com aïllar-lo de manera que puguin purificar zones que han estat contaminades per residus nuclears.)
      Salut humana: Són oportunistes i poc habituals, encara que cada vegada es troben més casos on el bacteri és patògen. Les uniques espècies aïllades en humans són S.putrefaciens i S.algae, que provoca la major part de les infeccions per causa encara desconeguda.
      Infeccions per Shewanella spp.:
      Pell i parts toves: celulitis, excessos…
      Oïda: otitis aguda o crònica.
      Ossos: artritis, osteomielitis…
      Sang: Bacteriemia, sapsis…
      Cor: Endocarditis, infecció aneurisma de l’aorta, pericarditis…
      SNC: Meningitis, excés cerebral
      Pulmons: pneumònia
      Ulls: Conjuntivitis…
      Fetge i tracte biliar: colangitis…
      Excrements: diarrea
      Peritoneu: peritonitis...

Articles:

Pàgines webs:


·       Nom: Pseudomonas putida

·       Classificació taxonòmica:
Fílum: Proteobacteria
Classe: Gammaproteobacteria
Ordre: Pseudomonadales
Família: Pseudomonadaceae
Gènere: Pseudomonadas

·       Característiques morfològiques: Morfologia de bacil recta o lleugerament corbada, gram negatiu, no formador d’espores, flagel·lat, té flagels múltiples polars en forma d’ona, mesura entre 0.5 i 0.6 μm de diàmetre i entre 1.4 i 1.7 μm de llargada, té una pigmentació verd-grogosa amb fluorescència.

·       Característiques metabòliques: És saprotròfic, capaç de degradar un gran nombre de compostos orgànics recalcitrants i dissolvents orgànics com ara el toluè. És oxidasa positiu, aeròbic estricte tot i que en alguns casos pot utilitzar el nitrat com a acceptor d’electrons. Té un metabolisme complex controlat per proteïnes en que hi participen molts factors i no només depèn del senyal rebut, sinó també els promotors i reguladors específics a la via  El catabolisme dels glúcids el fa per la ruta alternativa de Etner-Doudoroff i el cicle dels àcids tricarboxílics. El seu acceptor d’electrons és l’oxigen.

·       Característiques ecològiques: pot créixer entre 0 i 35 ºC però la seva temperatura òptima són 25ºC i a un PH òptim de 8. Es troba en la majoria dels hàbitats de sòl i aigua on hi ha oxigen, és molt adaptable al medi gràcies al seu control de les proteïnes i és resistent a substàncies tòxiques, per això es troba en tot tipus de zones. És poc freqüent trobar-lo en clíniques, al contrari que alguns bacteris del seu gènere. Té diverses soques incloent la KT2440, una soca que colonitza les arrels de les plantes en què hi ha una relació mútua entre la planta i bacteris.

·       Altres característiques, aplicacions o problemàtiques: Aquest bacteri té la majoria dels gens que participen en la descomposició d'hidrocarburs aromàtics o alifàtics, per tant, s’utilitza per a la bioremediació, gràcies a la degradació de aquestes substàncies, moltes tòxiques, i que les pot utilitzar com a font de carboni i nitrogen, elimina substàncies tòxiques i contaminants cosa que és important per a completar el cicle del carboni. En humans pot provocar pneumònia, peritonitis, bacteriuria, artritis sèptica, septisèmia post-transfusió i bacteriemia relacionada amb la contaminació d’aparells mèdics però generalment en pacients que ja estaven malalts, tot i així, la majoria de soques no són patògenes. En plantes s’associa amb les arrels, forma biopel·lícules o biofilms que protegeixen de fongs i d’altres bacteris donant-los-hi un nutrient necessari de manera que no necessitaran atacar. També s’utilitza en enginyeria genètica ja que és de cultiu fàcil i per la seva aplicació en fer plàstics biodegradables.

 ·      Bibliografia
Articles


Webs informació  

Centres d’investigació i tesis

Llibres


Marta Satorres, Rita Roura, Adriana Muntané